牛肝菌公司遵循“產權明晰、權責分明、政企分開、管理科學”的原則，按照《公司法》建立健全各項管理制度,完善企業管理機制。公司制定一整套符合廠情的規章制度，強化對企業的管理，加強對企業生產經營的民主管理和民主監督，以全面提高企業員工的凝聚力，不斷加強對員工的產品意識教育，以提高全體員工的綜合素質。公司對食品生產質量安全衛生實行全過程嚴格監控，保證產品品質100% 達到國際和國家的產品衛生標準，在國內外形象良好。由于全體職工的共同努力，公司于2003年被莆田市人民政府授予：“莆田市農業產業化龍頭企業”的稱號，同年，被福建省農業廳授予：“福建省農牧業產業化龍頭企業”的稱號。